KCNK4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3UM7, 4I9W, 4RUE, 4RUF, 4WFE, 4WFF, 4WFG, 4WFH

Ідентифікатори

Символи

KCNK4, K2p4.1, TRAAK, TRAAK1, potassium two pore domain channel subfamily K member 4, FHEIG

Зовнішні ІД

OMIM: 605720 MGI: 1298234 HomoloGene: 7391 GeneCards: KCNK4

Реагує на сполуку

Рилузол^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity • mechanosensitived potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • temperature-gated cation channel activity • potassium ion leak channel activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • potassium channel complex
Біологічний процес	• sensory perception of temperature stimulus • regulation of ion transmembrane transport • cellular response to alkaline pH • пам'ять • ion transport • cellular response to temperature stimulus • potassium ion transport • cellular response to mechanical stimulus • cellular response to fatty acid • potassium ion transmembrane transport • sensory perception of pain • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of touch • stabilization of membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50801


16528

Ensembl


ENSG00000182450


ENSMUSG00000024957

UniProt


Q9NYG8


O88454

RefSeq (мРНК)


NM_016611 NM_033310 NM_001317090


NM_008431

RefSeq (білок)


NP_001304019 NP_201567


NP_032457

Локус (UCSC)

Хр. 11: 64.29 – 64.3 Mb

Хр. 19: 6.9 – 6.91 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNK4 (англ. Potassium two pore domain channel subfamily K member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 42 704^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRSTTLLALL	ALVLLYLVSG	ALVFRALEQP	HEQQAQRELG	EVREKFLRAH
PCVSDQELGL	LIKEVADALG	GGADPETNST	SNSSHSAWDL	GSAFFFSGTI
ITTIGYGNVA	LRTDAGRLFC	IFYALVGIPL	FGILLAGVGD	RLGSSLRHGI
GHIEAIFLKW	HVPPELVRVL	SAMLFLLIGC	LLFVLTPTFV	FCYMEDWSKL
EAIYFVIVTL	TTVGFGDYVA	GADPRQDSPA	YQPLVWFWIL	LGLAYFASVL
TTIGNWLRVV	SRRTRAEMGG	LTAQAASWTG	TVTARVTQRA	GPAAPPPEKE
QPLLPPPPCP	AQPLGRPRSP	SPPEKAQPPS	PPTASALDYP	SENLAFIDES
SDTQSERGCP	LPRAPRGRRR	PNPPRKPVRP	RGPGRPRDKG	VPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lesage F., Maingret F., Lazdunski M. (2000). Cloning and expression of human TRAAK, a polyunsaturated fatty acids-activated and mechano-sensitive K(+) channel. FEBS Lett. 471: 137—140. PMID 10767409 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01388-0
Ozaita A., Vega-Saenz de Miera E. (2002). Cloning of two transcripts, HKT4.1a and HKT4.1b, from the human two-pore K+ channel gene KCNK4. Chromosomal localization, tissue distribution and functional expression. Brain Res. Mol. Brain Res. 102: 18—27. PMID 12191490 DOI:10.1016/S0169-328X(02)00157-2
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Brohawn S.G., del Marmol J., MacKinnon R. (2012). Crystal structure of the human K2P TRAAK, a lipid- and mechano-sensitive K+ ion channel. Science. 335: 436—441. PMID 22282805 DOI:10.1126/science.1213808
Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2013). Domain-swapped chain connectivity and gated membrane access in a Fab-mediated crystal of the human TRAAK K+ channel. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 2129—2134. PMID 23341632 DOI:10.1073/pnas.1218950110
Brohawn S.G., Campbell E.B., MacKinnon R. (2014). Physical mechanism for gating and mechanosensitivity of the human TRAAK K+ channel. Nature. 516: 126—130. PMID 25471887 DOI:10.1038/nature14013

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium two pore domain channel subfamily K member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6279 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NYG8 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані