KCNIP3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E6W

Ідентифікатори

Символи

KCNIP3, CSEN, DREAM, KCHIP3, potassium voltage-gated channel interacting protein 3

Зовнішні ІД

OMIM: 604662 MGI: 1929258 HomoloGene: 8382 GeneCards: KCNIP3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • calcium ion binding • sequence-specific DNA binding • potassium channel activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • voltage-gated ion channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • potassium channel regulator activity • transmembrane transporter binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • axon terminus • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • аксон • дендрит (нейробіологія) • protein-DNA complex • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • клітинна мембрана
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of ion transmembrane transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ion transport • transcription, DNA-templated • potassium ion transport • potassium ion transmembrane transport • protein localization to plasma membrane • intracellular protein transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


30818


56461

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000079056

UniProt


Q9Y2W7


Q9QXT8 P0C092

RefSeq (мРНК)


NM_001034914 NM_013434


NM_001111331 NM_001291005 NM_019789

RefSeq (білок)


NP_001030086 NP_038462


NP_001104801 NP_001277934 NP_062763

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 2: 127.3 – 127.36 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNIP3 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 256 амінокислот, а молекулярна маса — 29 231^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPAKEVTKA	SDGSLLGDLG	HTPLSKKEGI	KWQRPRLSRQ	ALMRCCLVKW
ILSSTAPQGS	DSSDSELELS	TVRHQPEGLD	QLQAQTKFTK	KELQSLYRGF
KNECPTGLVD	EDTFKLIYAQ	FFPQGDATTY	AHFLFNAFDA	DGNGAIHFED
FVVGLSILLR	GTVHEKLKWA	FNLYDINKDG	YITKEEMLAI	MKSIYDMMGR
HTYPILREDA	PAEHVERFFE	KMDRNQDGVV	TIEEFLEACQ	KDENIMSSMQ
LFENVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

Carrion A.M., Link W.A., Ledo F., Mellstrom B., Naranjo J.R. (1999). DREAM is a Ca2+-regulated transcriptional repressor. Nature. 398: 80—84. PMID 10078534 DOI:10.1038/18044
Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kunjilwar K., Strang C., DeRubeis D., Pfaffinger P.J. (2004). KChIP3 rescues the functional expression of Shal channel tetramerization mutants. J. Biol. Chem. 279: 54542—54551. PMID 15485870 DOI:10.1074/jbc.M409721200
Jerng H.H., Kunjilwar K., Pfaffinger P.J. (2005). Multiprotein assembly of Kv4.2, KChIP3 and DPP10 produces ternary channel complexes with ISA-like properties. J. Physiol. (Lond.). 568: 767—788. PMID 16123112 DOI:10.1113/jphysiol.2005.087858
Jerng H.H., Pfaffinger P.J. (2008). Multiple Kv channel-interacting proteins contain an N-terminal transmembrane domain that regulates Kv4 channel trafficking and gating. J. Biol. Chem. 283: 36046—36059. PMID 18957440 DOI:10.1074/jbc.M806852200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15523 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2W7 (англ.) . Архів оригіналу за 15 листопада 2016. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані