ASIC1

ASIC1
Ідентифікатори
Символи ASIC1, ACCN2, ASIC, BNaC2, acid sensing ion channel subunit 1
Зовнішні ІД OMIM: 602866 MGI: 1194915 HomoloGene: 121755 GeneCards: ASIC1
Реагує на сполуку
гідрон, amiloride, benzamil, ібупрофен, nafamostat[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

ion gated channel activity
sodium channel activity
ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
cation channel activity
ligand-gated sodium channel activity
acid-sensing ion channel activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
синапс
integral component of plasma membrane
cell surface
комплекс Ґольджі
клітинна мембрана

Біологічний процес

negative regulation of neurotransmitter secretion
associative learning
sodium ion transmembrane transport
sodium ion transport
regulation of membrane potential
cation transport
пам'ять
sensory perception of sour taste
ion transport
protein homotrimerization
ion transmembrane transport
cellular response to pH
calcium ion transmembrane transport
response to pH
GO:0072468 сигнальна трансдукція
response to acidic pH
calcium ion transport
behavioral fear response
response to amphetamine

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
41
11419
Ensembl
ENSG00000110881
ENSMUSG00000023017
UniProt
P78348
Q6NXK8
RefSeq (мРНК)
NM_001095
NM_001256830
NM_020039
NM_001289791
NM_009597
RefSeq (білок)
NP_001086
NP_001243759
NP_064423
NP_001276720
NP_033727
Локус (UCSC) Хр. 12: 50.06 – 50.08 Mb Хр. 15: 99.57 – 99.6 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ASIC1 (англ. Acid sensing ion channel subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 528 амінокислот, а молекулярна маса — 59 909[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MELKAEEEEVGGVQPVSIQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCF
LGSLAVLLCVCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRF
SQVSKNDLYHAGELLALLNNRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPK
PFNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEVCSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSG
RDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIH
SQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSDLD
FFDSYSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKECADPAL
DFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQY
IGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTV
LELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESL
RGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт натрію, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Garcia-Anoveros J., Derfler B.H., Neville-Golden J., Hyman B.T., Corey D.P. (1997). BNaC1 and BNaC2 constitute a new family of human neuronal sodium channels related to degenerins and epithelial sodium channels. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 1459—1464. PMID 9037075 DOI:10.1073/pnas.94.4.1459
  • Hoagland E.N., Sherwood T.W., Lee K.G., Walker C.J., Askwith C.C. (2010). Identification of a calcium permeable human acid-sensing ion channel 1 transcript variant. J. Biol. Chem. 285: 41852—41862. PMID 21036899 DOI:10.1074/jbc.M110.171330
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hruska-Hageman A.M., Wemmie J.A., Price M.P., Welsh M.J. (2002). Interaction of the synaptic protein PICK1 (protein interacting with C kinase 1) with the non-voltage gated sodium channels BNC1 (brain Na+ channel 1) and ASIC (acid-sensing ion channel). Biochem. J. 361: 443—450. PMID 11802773 DOI:10.1042/0264-6021:3610443
  • Poirot O., Vukicevic M., Boesch A., Kellenberger S. (2004). Selective regulation of acid-sensing ion channel 1 by serine proteases. J. Biol. Chem. 279: 38448—38457. PMID 15247234 DOI:10.1074/jbc.M407381200
  • Er S.Y., Cristofori-Armstrong B., Escoubas P., Rash L.D. (2017). Discovery and molecular interaction studies of a highly stable, tarantula peptide modulator of acid-sensing ion channel 1. Neuropharmacology. 114: 3750—3755. PMID 28327374 DOI:10.1016/j.neuropharm.2017.03.020

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Acid sensing ion channel subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:100 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P78348 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class