ESRRA

ESRRA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1XB7, 2PJL, 3D24, 3K6P

Ідентифікатори
Символи ESRRA, ERR1, ERRa, ERRalpha, ESRL1, NR3B1, estrogen related receptor alpha
Зовнішні ІД OMIM: 601998 MGI: 1346831 HomoloGene: 136738 GeneCards: ESRRA
Реагує на сполуку
biochanin A, Дайджеїн, Геністейн, XCT790[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
protein domain specific binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
steroid hormone receptor activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
steroid binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

microtubule cytoskeleton
нуклеоплазма
intercellular bridge
клітинне ядро
fibrillar center
цитоплазма

Біологічний процес

response to estradiol
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of cellular response to insulin stimulus
mitochondrion organization
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
cartilage development
regulation of cell population proliferation
regulation of osteoblast differentiation
regulation of osteoclast differentiation
regulation of ossification
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
steroid hormone mediated signaling pathway
intracellular receptor signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2101
26379
Ensembl
ENSG00000173153
ENSMUSG00000024955
UniProt
P11474
O08580
RefSeq (мРНК)
NM_001282450
NM_001282451
NM_004451
NM_007953
RefSeq (білок)
NP_001269379
NP_001269380
NP_004442
NP_031979
Локус (UCSC) Хр. 11: 64.31 – 64.32 Mb Хр. 19: 6.89 – 6.9 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Естроген-пов'язаний рецептор альфа (англ. Estrogen related receptor alpha) – білок, який кодується геном ESRRA, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 45 510[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGH
KEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACK
AFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVR
LDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPVNALVSH
LLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFS
SLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAA
GLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQ
LREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFY
GVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Giguere V., Yang N., Segui P., Evans R.M. (1988). Identification of a new class of steroid hormone receptors. Nature. 331: 91—94. PMID 3267207 DOI:10.1038/331091a0
  • Yang N., Shigeta H., Shi H., Teng C.T. (1996). Estrogen-related receptor, hERR1, modulates estrogen receptor-mediated response of human lactoferrin gene promoter. J. Biol. Chem. 271: 5795—5804. PMID 8621448 DOI:10.1074/jbc.271.10.5795
  • Sladek R., Bader J.-A., Giguere V. (1997). The orphan nuclear receptor estrogen-related receptor alpha is a transcriptional regulator of the human medium-chain acyl coenzyme A dehydrogenase gene. Mol. Cell. Biol. 17: 5400—5409. PMID 9271417 DOI:10.1128/MCB.17.9.5400
  • Schreiber S.N., Knutti D., Brogli K., Uhlmann T., Kralli A. (2003). The transcriptional coactivator PGC-1 regulates the expression and activity of the orphan nuclear receptor estrogen-related receptor alpha (ERRalpha). J. Biol. Chem. 278: 9013—9018. PMID 12522104 DOI:10.1074/jbc.M212923200
  • Barry J.B., Laganiere J., Giguere V. (2006). A single nucleotide in an estrogen-related receptor alpha site can dictate mode of binding and peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1alpha activation of target promoters. Mol. Endocrinol. 20: 302—310. PMID 16150865 DOI:10.1210/me.2005-0313
  • Vu E.H., Kraus R.J., Mertz J.E. (2007). Phosphorylation-dependent sumoylation of estrogen-related receptor alpha1. Biochemistry. 46: 9795—9804. PMID 17676930 DOI:10.1021/bi700316g

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Estrogen related receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3471 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, P11474 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші