BCL6

BCL6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1R28, 1R29, 1R2B, 2EN2, 2EOS, 2LCE, 2YRM, 3BIM, 3E4U, 3LBZ, 4CP3, 4U2M

Ідентифікатори
Символи BCL6, BCL5, BCL6A, LAZ3, ZBTB27, ZNF51, B-cell CLL/lymphoma 6, B cell CLL/lymphoma 6, transcription repressor, BCL6 transcription repressor
Зовнішні ІД OMIM: 109565 MGI: 107187 HomoloGene: 7640 GeneCards: BCL6
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
nucleic acid binding
chromatin DNA binding
identical protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

replication fork
клітинне ядро
нуклеоплазма
комплекс Ґольджі

Біологічний процес

regulation of germinal center formation
positive regulation of histone deacetylation
negative regulation of T-helper 2 cell differentiation
GO:0034613 protein localization
negative regulation of mast cell cytokine production
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
процес імунної системи
GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell differentiation
germinal center formation
negative regulation of Rho protein signal transduction
negative regulation of isotype switching to IgE isotypes
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
type 2 immune response
cellular response to DNA damage stimulus
negative regulation of cell-matrix adhesion
regulation of cell population proliferation
positive regulation of B cell proliferation
negative regulation of cell growth
Rho protein signal transduction
GO:0000767 cell morphogenesis
Сперматогенез
regulation of memory T cell differentiation
positive regulation of neuron differentiation
regulation of inflammatory response
regulation of immune response
positive regulation of apoptotic process
negative regulation of type 2 immune response
negative regulation of B cell apoptotic process
B cell differentiation
inflammatory response
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
actin cytoskeleton organization
negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of Notch signaling pathway
erythrocyte development
negative regulation of cellular senescence
regulation of apoptotic process
negative regulation of mitotic cell cycle DNA replication
positive regulation of regulatory T cell differentiation
cytokine-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
604
12053
Ensembl
ENSG00000113916
ENSMUSG00000022508
UniProt
P41182
P41183
RefSeq (мРНК)
NM_001130845
NM_001134738
NM_001706
NM_138931
NM_009744
NM_001348026
RefSeq (білок)
NP_001124317
NP_001128210
NP_001697
NP_001334955
NP_033874
Локус (UCSC) Хр. 3: 187.72 – 187.75 Mb Хр. 16: 23.78 – 23.81 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BCL6 (англ. B-cell CLL/lymphoma 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 706 амінокислот, а молекулярна маса — 78 846[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASPADSCIQFTRHASDVLLNLNRLRSRDILTDVVIVVSREQFRAHKTVL
MACSGLFYSIFTDQLKCNLSVINLDPEINPEGFCILLDFMYTSRLNLREG
NIMAVMATAMYLQMEHVVDTCRKFIKASEAEMVSAIKPPREEFLNSRMLM
PQDIMAYRGREVVENNLPLRSAPGCESRAFAPSLYSGLSTPPASYSMYSH
LPVSSLLFSDEEFRDVRMPVANPFPKERALPCDSARPVPGEYSRPTLEVS
PNVCHSNIYSPKETIPEEARSDMHYSVAEGLKPAAPSARNAPYFPCDKAS
KEEERPSSEDEIALHFEPPNAPLNRKGLVSPQSPQKSDCQPNSPTESCSS
KNACILQASGSPPAKSPTDPKACNWKKYKFIVLNSLNQNAKPEGPEQAEL
GRLSPRAYTAPPACQPPMEPENLDLQSPTKLSASGEDSTIPQASRLNNIV
NRSMTGSPRSSSESHSPLYMHPPKCTSCGSQSPQHAEMCLHTAGPTFPEE
MGETQSEYSDSSCENGAFFCNECDCRFSEEASLKRHTLQTHSDKPYKCDR
CQASFRYKGNLASHKTVHTGEKPYRCNICGAQFNRPANLKTHTRIHSGEK
PYKCETCGARFVQVAHLRAHVLIHTGEKPYPCEICGTRFRHLQTLKSHLR
IHTGEKPYHCEKCNLHFRHKSQLRLHLRQKHGAITNTKVQYRVSATDLPP
ELPKAC

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Niu H., Ye B.H., Dalla-Favera R. (1998). Antigen receptor signaling induces MAP kinase-mediated phosphorylation and degradation of the BCL-6 transcription factor. Genes Dev. 12: 1953—1961. PMID 9649500 DOI:10.1101/gad.12.13.1953
  • Bereshchenko O.R., Gu W., Dalla-Favera R. (2002). Acetylation inactivates the transcriptional repressor BCL6. Nat. Genet. 32: 606—613. PMID 12402037 DOI:10.1038/ng1018
  • Mascle X., Albagli O., Lemercier C. (2003). Point mutations in BCL6 DNA-binding domain reveal distinct roles for the six zinc fingers. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 391—396. PMID 12504096 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02873-5
  • Phan R.T., Dalla-Favera R. (2004). The BCL6 proto-oncogene suppresses p53 expression in germinal-centre B-cells. Nature. 432: 635—639. PMID 15577913 DOI:10.1038/nature03147
  • Phan R.T., Saito M., Basso K., Niu H., Dalla-Favera R. (2005). BCL6 interacts with the transcription factor Miz-1 to suppress the cyclin-dependent kinase inhibitor p21 and cell cycle arrest in germinal center B cells. Nat. Immunol. 6: 1054—1060. PMID 16142238 DOI:10.1038/ni1245

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1001 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, P41182 (англ.) . Архів оригіналу за 18 травня 2013. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші