Imunoglobulinski domen

IImunoglobulinski domen
Struktura fragmenta koji se vezuje za antigen antitela
Identifikatori
Simbolig
PfamPF00047
Pfam klanCL0011
InterProIPR013151
PROSITEPDOC00262
SCOP8fab
SUPERFAMILY8fab
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Imunoglobulinski domen je tip proteinskog domena koji se sastoji od dvoslojnog sendviča sa 7 i 9 antiparalelnih β-lanaca koji formiraju β-ravni sa topologijom Grčkog kluča.[1][2]

Aminokiselinski lanac više puta prelazi iz jedne β-ravni u drugu. Tipičan obrazac je (N-terminalna β-ukosnica u ravni 1)-(β-ukosnica u ravni 2)-(β-lanac u ravni 1)-(C-terminalna β-ukosnica u ravni 2). Prelazi između dve ravni formiraju "X", tako da su N- i C-terminalne ukosnica jedna naspram druge.

Članovi imunoglobulinske superfamilije su prisutni u stotinama proteina sa različitim funkcijama. Primeri tih proteina su antitela, gigantska mišićna kinaza titin i receptorske tirozinske kinaze. Imunoglobulinu slični domeni mogu da učestvujuju u protein–protein i protein–ligand interakcijama.[3]

Primeri

Ljudski geni koji kodiraju proteine sa imunoglobulinskim domenom:

  • A1BG
  • ACAM
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL3
  • AGER
  • ALCAM
  • AMIGO1
  • AMIGO2
  • AXL
  • BCAM
  • BOC
  • BSG
  • BTLA
  • C10orf72
  • C20orf102
  • CADM1
  • CADM3
  • CD200
  • CD22
  • CD276
  • CD33
  • CD4
  • CDON
  • CEACAM1
  • CEACAM16
  • CEACAM20
  • CEACAM21
  • CEACAM5
  • CEACAM6
  • CEACAM8
  • CHL1
  • CILP
  • CNTFR
  • CNTN1
  • CNTN2
  • CNTN3
  • CNTN4
  • CNTN5
  • CNTN6
  • CSF1R
  • DSCAM
  • DSCAML1
  • EMB
  • F11R
  • FAIM3
  • FCAR
  • FCER1A
  • FCGR1A
  • FCGR2A
  • FCGR2B
  • FCGR2C
  • FCGR3A
  • FCGR3B
  • FCRH1
  • FCRH3
  • FCRH4
  • FCRL1
  • FCRL2
  • FCRL3
  • FCRL4
  • FCRL5
  • FCRL6
  • FCRLA
  • FGFR1
  • FGFR2
  • FGFR3
  • FGFR4
  • FGFRL1
  • FLT1
  • FLT3
  • FLT4
  • FSTL4
  • FSTL5
  • GP6
  • GPA33
  • GPR116
  • GPR125
  • HEPACAM
  • HLA-DMA
  • HLA-DMB
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HMCN1
  • HNT
  • HSPG2
  • HYST2477
  • ICAM3
  • ICAM5
  • IGHA1
  • IGHD
  • IGHE
  • IGSF10
  • IGSF11
  • IGSF2
  • IGSF21
  • IGSF3
  • IGSF9
  • IL11RA
  • IL1R1
  • IL1R2
  • IL1RAPL1
  • IL1RAPL2
  • IL1RL1
  • IL1RL2
  • IL6R
  • JAM2
  • JAM3
  • KIR-123FM
  • KIR2DL1
  • KIR2DL2
  • KIR2DL3
  • KIR2DL4
  • KIR2DL5A
  • KIR2DL5B
  • KIR2DLX
  • KIR2DS1
  • KIR2DS2
  • KIR2DS3
  • KIR2DS4
  • KIR2DS5
  • KIR3DL1
  • KIR3DL2
  • KIR3DL3
  • KIR3DS1
  • KIT
  • L1CAM
  • LAG3
  • LILRA1
  • LILRA2
  • LILRA3
  • LILRA4
  • LILRA5
  • LILRA6
  • LILRB1
  • LILRB2
  • LILRB3
  • LILRB4
  • LILRB5
  • LILRP2
  • LRIG1
  • LRIG2
  • LRIG3
  • LRIT1
  • LRRC4
  • LSAMP
  • MAG
  • MALT1
  • MCAM
  • MDGA1
  • MDGA2
  • MERTK
  • MFAP3
  • MIR
  • MIR
  • MXRA5
  • MYBPC3
  • MYOM1
  • MYOM3
  • NCA
  • NCAM1
  • NCAM2
  • NEGR1
  • NEO1
  • NFASC
  • NOPE
  • NPHS1
  • NPTN
  • NRCAM
  • NRG1
  • NT
  • NTRK3
  • OBSCN
  • OBSL1
  • OPCML
  • PAPLN
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDGFRL
  • PECAM1
  • PRODH2
  • PSG1
  • PSG10
  • PSG11
  • PSG11s'
  • PSG2
  • PSG3
  • PSG4
  • PSG5
  • PSG6
  • PSG7
  • PSG8
  • PSG9
  • PTGFRN
  • PTK7
  • PTPRD
  • PTPRK
  • PTPRM
  • PTPRS
  • PTPsigma
  • PUNC
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL4
  • RAGE
  • SCN1B
  • SDK1
  • SDK2
  • SEMA3A
  • SEMA3B
  • SEMA3E
  • SEMA3F
  • SEMA3G
  • SEMA4D
  • SIGLEC1
  • SIGLEC10
  • SIGLEC11
  • SIGLEC12
  • SIGLEC14
  • SIGLEC6
  • SIGLEC7
  • SIGLEC8
  • SIRPG
  • THY1
  • TIE1
  • TMIGD1
  • TMIGD2
  • TTN
  • TYRO3
  • UNC5D
  • VCAM1
  • VSIG1
  • VSIG2
  • VSIG4
  • hEMMPRIN
  • kir3d

Reference

  1. ^ Bork P, Holm L, Sander C (1994). „The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core”. J. Mol. Biol. 242 (4): 309—20. PMID 7932691. doi:10.1006/jmbi.1994.1582. 
  2. ^ Brümmendorf T, Rathjen FG (1995). „Cell adhesion molecules 1: immunoglobulin superfamily”. Protein Profile. 2 (9): 963—1108. PMID 8574878. 
  3. ^ Williams AF, Barclay AN (1988). „The immunoglobulin superfamily—domains for cell surface recognition”. Annu. Rev. Immunol. 6: 381—405. PMID 3289571. doi:10.1146/annurev.iy.06.040188.002121. 

See also

Spoljašnje veze

  • SCOP listing of immunoglobulin domains of known structure