Imunoglobulinska superfamilija

Imunoglobulinska superfamilija
Antitelo u kompleksu sa lizozimom belanca kokošijeg jajeta.[1]
Identifikatori
SimbolIgSF
PfamPF00047
Pfam klanCL0011
InterProIPR013151
PROSITEPS50835
SCOP1tlk
SUPERFAMILY1tlk
OPM superfamilija230
OPM protein3bib
CDDcd00096
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Imunoglobulinska superfamilija (IgSF) je velika grupa membranskih i rastvornih proteina, koja učestvuje u prepoznavanju, vezivanju, ili adhezionim procesima ćelija. Molekuli su grupisani u ovu superfamiliju na osnovu zajedničkih strukturnih svojstava sa imunoglobulinima (takođe poznatim kao antitela). Svi oni poseduju domen poznat kao imunoglobulinski domen ili savijanje. Članovi IgSF su antigenski receptori sa ćelijske površine, koreceptorski i kostimulatorni molekuli imunskog sistema, molekuli koji učestvuju u prezentaciji antigena na limfocitima, ćelijski adhezivni molekuli, pojedini citokinski receptori i intracelularni mišićni proteini. Oni se često deo imunskog sistema.

Imunoglobulinski domeni

Proteini imunoglobulinska superfamilije poseduju strukturni domen poznat kao imunoglobulin (Ig) domen. Ig domeni su dobili ime po molekulu imunoglobulina. Oni sadrže oko 70-110 aminokiselina i grupišu se na osnovu njihove veličine i funkcije.[2] Ig-domeni poseduju karakteristično imunoglobulinsko savijanje, koje ima strukturu sličnu sendviću formiranu od dve ravni sa antiparalnim beta lancima. Interakcije između hidrofobnih aminokiselina unutrašnje strane sendviča i visoko konzervirane disulfidne veze formirane između cisteina u B i F lancima, stabilizuju Ig-savijanje. Jedan kraj Ig domena ima sekciju koja se naziva region određivanja komplementarnosti koji je važan za specificifičnost antitela za njihove ligande.

Klasifikacija

Domeni koji su slični sa Ig se mogu klasifikovati kao IgV, IgC1, IgC2, ili IgI.[3]

Većina Ig domena su bilo promenljivi (IgV) ili konstantni (IgC).

  • IgV: IgV domeni sa 9 beta lanaca su generalno duži od IgC domena sa 7 beta lanaca.
  • IgC1 i IgC2: Ig domeni nekih IgSF članova podsećaju na IgV domene po aminokiselinskim sekvencama, mada imaju sličnu veličinu sa IgC domenima. Oni se nazivaju IgC2 domenima, dok se standardni IgC domeni nazivaju IgC1 domenima.
  • IgI: Drugi Ig domeni koji se nazivaju intermedijerni (I) domeni.[4]

Reference

  1. ^ Dall'Acqua W; Goldman ER; Lin W; et al. (1998). „A mutational analysis of binding interactions in an antigen-antibody protein-protein complex”. Biochemistry. 37 (22): 7981—91. PMID 9609690. doi:10.1021/bi980148j. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  2. ^ Barclay A (2003). „Membrane proteins with immunoglobulin-like domains--a master superfamily of interaction molecules”. Semin Immunol. 15 (4): 215—23. PMID 14690046. doi:10.1016/S1044-5323(03)00047-2. 
  3. ^ B. D. Gomperts; Kramer, Ijsbrand M.; Peter E. R. Tatham (2009). Signal transduction. Academic Press. стр. 378—. ISBN 978-0-12-369441-6. Приступљено 28. 11. 2010. 
  4. ^ Harpaz Y, Chothia C (1994). „Many of the immunoglobulin superfamily domains in cell adhesion molecules and surface receptors belong to a new structural set which is close to that containing variable domains”. J. Mol. Biol. 238 (4): 528—39. PMID 8176743. doi:10.1006/jmbi.1994.1312. 

Literatura

Spoljašnje veze

  • п
  • р
  • у
Transmembranski: Imunoglobulinska superfamilija imunskih receptora
Receptori za antitela:
Fc receptor
Epsilon (ε)
FcεRI · (FcεRII je C-tip lektin)
Gama (γ)
FcγRI • FcγRII • FcγRIII • Neonatalni
Alfa (α)/mu (μ)
FcαRI · Fcα/μR
Sekretorni
Polimerni imunoglobulinski receptor
Receptori za antigene
B ćelije
Antigenski receptor
Koreceptori
stimuliše: CD21/CD19/CD81
inhibira: CD22
Pomoćni molekuli
Ig-α/Ig-β (CD79)
T ćelije
Ligandi
MHC (MHC klasa I i MHC klasa II)
Antigenski receptor
TCR: TRA@ · TRB@ · TRD@ · TRG@
Koreceptori
CD8 (sa dva glikoproteinska lanca CD8α i CD8β) · CD4
Pomoćni molekuli
CD3 · CD3γ · CD3δ · CD3ε · ζ-lanac (CD3ζ i TCRζ)
Citokinski receptor
Pogledajte citokinski receptori
Receptori ćelija ubica slični IG
KIR2DL1, KIR2DL2, KIR2DL3, KIR2DL4, KIR2DL5A, KIR2DL5B, KIR2DS1, KIR2DS2, KIR2DS3, KIR2DS4, KIR2DS5, KIR3DL1, KIR3DL2, KIR3DL3, KIR3DS1
Leukocitni receptori slični IG
LILRA1 · LILRA2 · LILRA3 · LILRA4 · LILRA5 · LILRA6 · LILRB1 · LILRB2 · LILRB3 · LILRB4 · LILRB5 · LILRA6 · LILRA5
  • п
  • р
  • у
Hemokinski receptor
(GPCR)
CC hemokinski receptori
  • CCR1
  • CCRL1
  • CCR2
  • CCRL2
  • CCR3
  • CCR4
  • CCR5
  • CCR6
  • CCR7
  • CCR8
  • CCR9
  • CCR10
  • CXC hemokinski receptori
    • IL-8
      • CXCR1
      • CXCR2
    • CXCR3
    • CXCR4
    • CXCR5
    • CXCR6
    • CXCR7
    Drugi
    • CCBP2
    • CMKLR1
    • CX3CR1
    • XCR1
    TNF receptor
    1-10
  • TNFRSF1 (CD120)
  • TNFRSF1A (CD120a)
  • TNFRSF1B (CD120b)
  • TNFRSF3 (Limfotoksin beta receptor)
  • TNFRSF4 (CD134)
  • TNFRSF5 (CD40)
  • TNFRSF6 (FAS)
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF7 (CD27)
  • TNFRSF8 (CD30)
  • TNFRSF9 (CD137)
  • 11-20
    • TNFRSF10A (CD261)
    • TNFRSF10B (CD262)
    • TNFRSF10C (CD263)
    • TNFRSF10D (CD264)
    • TNFRSF11A (CD265/RANK)
    • TNFRSF11B (Osteoprotegerin)
    • TNFRSF12A (CD266)
    • TNFRSF13B (CD267)
    • TNFRSF13C
    • TNFRSF14 (CD268)
    • TNFRSF16 (Receptor nervnog faktora rasta)
    • TNFRSF17 (CD269)
    • TNFRSF18
    • TNFRSF19
    21-25
    • TNFRSF21
    • TNFRSF25
    • TNFRSF27
    JAK-STAT
    Tip I
  • zajednički beta lanac: Interleukinski receptori
  • GM-CSF
    • drugi CSF receptori (EPO
    • G-CSF
    • Trombopoietin
    Tip II
    • Interleukini
      • 10
      • 20
      • 22
      • 28
    • interferon
      • -α/β
    Ig superfamilija
    • CSF1
    • C-kit
    • IL-1 (IL1R1
    • IL1R2
    • IL-18
    S/T
    • TGF-beta (1
    • 2)
    Drugi
    • IL-17 (IL17RA
    • IL17RB
    • IL17RC
    • IL17RD
    • IL17RE)