Tioredoksinski sklop

Tioredoksin
Molekul ljudskog tioredoksina (1ERT​)
Identifikatori
SimbolThioredoxin
PfamPF00085
Pfam klanCL0172
InterProIPR013766
PROSITEPDOC00172
SCOP3trx
SUPERFAMILY3trx
CDDcd01659
Dostupne proteinske strukture:
Pfamstructures
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Tioredoksinski sklop je proteinsko savijanje koje se često javlja u enzimima koji katalizuju formiranje disulfidne veze i izomerizaciju. Sklop nosi ime po kanoničkom primeru proteina sa ovim motivom, tioredoksinu. Ovaj sklop se javlja kod prokariotskih i eukariotskih proteina. Tioredoksinski sklop je primer alpa/beta proteinskog savijanja koji ima oksidoreduktaznu aktivnost. On ima prostornu topologiju koja se sastoji od četvorolančane antiparalelne beta ravni smeštene između tri alfa heliksa.

Konzervacija sekvence

Uprkos varijabilnosti sekvenci u mnogim regionima sklopa, tioredoksinski proteini imaju zajedničku sekvencu aktivnog mesta sa dva reaktivna cisteinska ostatka: Cys-X-Y-Cys, gde su X i Y obično hidrofobne aminokiseline. Redukovana forma proteina sadrži dve slobodne tiolne grupe na cisteinskim ostacima, dok oksidovana forma sadrži disulfidnu vezu između njih.

Primeri

Ljudski proteini sa ovim domenom su :

  • DNAJC10
  • ERP70
  • GLRX3
  • P4HB; P5; PDIA2; PDIA3; PDIA4; PDIA5; PDIA6; PDILT
  • QSOX1; QSOX2
  • STRF8
  • TXN; TXN2; TXNDC1; TXNDC10; TXNDC11; TXNDC13; TXNDC14; TXNDC15; TXNDC16; TXNDC2; TXNDC3; TXNDC4; TXNDC5; TXNDC6; TXNDC8; TXNL1; TXNL3

Literatura

  • Creighton TE. (2000). Protein folding coupled to disulphide-bond formation. In Mechanisms of Protein Folding 2nd ed. Editor RH Pain. Oxford University Press.

Spoljašnje veze

  • SCOP thioredoxin superfamily
  • CATH glutaredoxin topology