SOX4

بنى متوفرة

Ortholog search: PDBe RCSB

قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
3U2B

معرفات

أسماء بديلة

SOX4, EVI16, SRY-box 4, SRY-box transcription factor 4, CSS10

معرفات خارجية

الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 184430 MGI: MGI:98366 HomoloGene: 2338 GeneCards: 6659

علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ربط دي إن إي • ‏GO:0001105 transcription coactivator activity • ‏GO:0001077، ‏GO:0001212، ‏GO:0001213، ‏GO:0001211، ‏GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • ‏GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • core promoter sequence-specific DNA binding • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • protein heterodimerization activity • ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • ‏GO:0001200، ‏GO:0001133، ‏GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • ‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
مكونات خلوية	• سيتوبلازم • بلازم نووي • ميتوكندريون • نواة
عمليات حيوية	• skeletal system development • noradrenergic neuron differentiation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • cardiac ventricle formation • glial cell development • ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا • limb bud formation • regulation of protein stability • sympathetic nervous system development • somatic stem cell population maintenance • glucose homeostasis • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • ventricular septum morphogenesis • protein stabilization • ascending aorta morphogenesis • negative regulation of cell death • mitral valve morphogenesis • positive regulation of translation • نسخ الدنا • neuroepithelial cell differentiation • ‏GO:0060469، ‏GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of Wnt signaling pathway • negative regulation of protein ubiquitination • نماء القلب • pro-B cell differentiation • atrial septum primum morphogenesis • T cell differentiation • kidney morphogenesis • ضبط زيادي للتكاثر الخلوي • spinal cord development • positive regulation of apoptotic process • glial cell proliferation • canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of N-terminal peptidyl-lysine acetylation • spinal cord motor neuron differentiation • cardiac right ventricle morphogenesis • neural tube formation • cellular response to glucose stimulus • endocrine pancreas development • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of insulin secretion • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني • transcription by RNA polymerase II • تمايز خلوي
المصادر:Amigo / QuickGO

نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي

المزيد من بيانات التعبير المرجعية

تماثلات متسلسلة

أنواع

الإنسان

الفأر

أنتريه

6659

20677

Ensembl

ENSG00000124766

ENSMUSG00000076431

يونيبروت


Q06945


Q06831

RefSeq (رنا مرسال.)


NM_003107


NM_009238

RefSeq (بروتين)


NP_003098


NP_033264

الموقع (UCSC

n/a

Chr 13: 29.13 – 29.14 Mb

بحث ببمد

[1]

[2]

ويكي بيانات

اعرض/عدّل إنسان

اعرض/عدّل فأر

SOX4‏ (SRY-box 4) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SOX4 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

^ Farr CJ، Easty DJ، Ragoussis J، Collignon J، Lovell-Badge R، Goodfellow PN (يناير 1994). "Characterization and mapping of the human SOX4 gene". Mamm Genome. ج. 4 ع. 10: 577–84. DOI:10.1007/BF00361388. PMID:8268656.
^ Critcher R، Stitson RN، Wade-Martins R، Easty DJ، Farr CJ (أكتوبر 1998). "Assignment of Sox4 to mouse chromosome 13 bands A3-A5 by fluorescence in situ hybridization; refinement of the human SOX4 location to 6p22.3 and of SOX20 to chromosome 17p12.3". Cytogenet Cell Genet. ج. 81 ع. 3–4: 294–5. DOI:10.1159/000015052. PMID:9730625.
^ "Entrez Gene: SOX4 SRY (sex determining region Y)-box 4". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

Kamachi Y، Uchikawa M، Kondoh H (2000). "Pairing SOX off: with partners in the regulation of embryonic development". Trends Genet. ج. 16 ع. 4: 182–7. DOI:10.1016/S0168-9525(99)01955-1. PMID:10729834.
Bowles J، Schepers G، Koopman P (2001). "Phylogeny of the SOX family of developmental transcription factors based on sequence and structural indicators". Dev. Biol. ج. 227 ع. 2: 239–55. DOI:10.1006/dbio.2000.9883. PMID:11071752.
Wilson M، Koopman P (2003). "Matching SOX: partner proteins and co-factors of the SOX family of transcriptional regulators". Curr. Opin. Genet. Dev. ج. 12 ع. 4: 441–6. DOI:10.1016/S0959-437X(02)00323-4. PMID:12100890.
Schepers GE، Teasdale RD، Koopman P (2002). "Twenty pairs of sox: extent, homology, and nomenclature of the mouse and human sox transcription factor gene families". Dev. Cell. ج. 3 ع. 2: 167–70. DOI:10.1016/S1534-5807(02)00223-X. PMID:12194848.
Denny P، Swift S، Brand N، Dabhade N، Barton P، Ashworth A (1992). "A conserved family of genes related to the testis determining gene, SRY". Nucleic Acids Res. ج. 20 ع. 11: 2887. DOI:10.1093/nar/20.11.2887. PMC:336939. PMID:1614875.
Wotton D، Lake RA، Farr CJ، Owen MJ (1995). "The high mobility group transcription factor, SOX4, transactivates the human CD2 enhancer". J. Biol. Chem. ج. 270 ع. 13: 7515–22. DOI:10.1074/jbc.270.13.7515. PMID:7706298.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
van de Wetering M، Oosterwegel M، van Norren K، Clevers H (1993). "Sox-4, an Sry-like HMG box protein, is a transcriptional activator in lymphocytes". EMBO J. ج. 12 ع. 10: 3847–54. PMC:413668. PMID:8404853.
van Houte LP، Chuprina VP، van der Wetering M، Boelens R، Kaptein R، Clevers H (1996). "Solution structure of the sequence-specific HMG box of the lymphocyte transcriptional activator Sox-4". J. Biol. Chem. ج. 270 ع. 51: 30516–24. DOI:10.1074/jbc.270.51.30516. PMID:8530483.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Ahn SG، Cho GH، Jeong SY، Rhim H، Choi JY، Kim IK (1999). "Identification of cDNAs for Sox-4, an HMG-Box protein, and a novel human homolog of yeast splicing factor SSF-1 differentially regulated during apoptosis induced by prostaglandin A2/delta12-PGJ2 in Hep3B cells". Biochem. Biophys. Res. Commun. ج. 260 ع. 1: 216–21. DOI:10.1006/bbrc.1999.0856. PMID:10381369.
van Beest M، Dooijes D، van De Wetering M، Kjaerulff S، Bonvin A، Nielsen O، Clevers H (2000). "Sequence-specific high mobility group box factors recognize 10-12-base pair minor groove motifs". J. Biol. Chem. ج. 275 ع. 35: 27266–73. DOI:10.1074/jbc.M004102200. PMID:10867006.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Reppe S، Rian E، Jemtland R، Olstad OK، Gautvik VT، Gautvik KM (2001). "Sox-4 messenger RNA is expressed in the embryonic growth plate and regulated via the parathyroid hormone/parathyroid hormone-related protein receptor in osteoblast-like cells". J. Bone Miner. Res. ج. 15 ع. 12: 2402–12. DOI:10.1359/jbmr.2000.15.12.2402. PMID:11127205.
Geijsen N، Uings IJ، Pals C، Armstrong J، McKinnon M، Raaijmakers JA، Lammers JW، Koenderman L، Coffer PJ (2001). "Cytokine-specific transcriptional regulation through an IL-5Ralpha interacting protein". Science. ج. 293 ع. 5532: 1136–8. DOI:10.1126/science.1059157. PMID:11498591.
Lee CJ، Appleby VJ، Orme AT، Chan WI، Scotting PJ (2003). "Differential expression of SOX4 and SOX11 in medulloblastoma". J. Neurooncol. ج. 57 ع. 3: 201–14. DOI:10.1023/A:1015773818302. PMID:12125983.
Ahn SG، Kim HS، Jeong SW، Kim BE، Rhim H، Shim JY، Kim JW، Lee JH، Kim IK (2003). "Sox-4 is a positive regulator of Hep3B and HepG2 cells' apoptosis induced by prostaglandin (PG)A(2) and delta(12)-PGJ(2)". Experimental & Molecular Medicine. ج. 34 ع. 3: 243–9. DOI:10.1038/emm.2002.34. PMID:12216117.