TUBA1A

TUBA1A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3HKC, 4X20, 3HKE, 3N2G, 4X1Y, 3N2K, 4X1I, 4X1K, 3HKB, 3HKD, 5JCO

Ідентифікатори
Символи TUBA1A, B-ALPHA-1, LIS3, TUBA3, tubulin alpha 1a
Зовнішні ІД OMIM: 602529 MGI: 98869 HomoloGene: 68498 GeneCards: TUBA1A
Пов'язані генетичні захворювання
lissencephaly due to TUBA1A mutation[1]
Реагує на сполуку
velban, ixabepilone, plinabulin, vinblastine sulfate, patupilone, vincristine sulfate, dolastatin 10[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
protein domain specific binding
GTP binding
structural molecule activity
structural constituent of cytoskeleton
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0006184 GTPase activity

Клітинна компонента

цитоплазма
recycling endosome
гіалоплазма
myelin sheath
cytoplasmic microtubule
cytoplasmic ribonucleoprotein granule
мікротрубочка
екзосома
цитоскелет
клітинне ядро
microtubule cytoskeleton
membrane raft
neuromuscular junction

Біологічний процес

cytoskeleton-dependent intracellular transport
поділ клітини
G2/M transition of mitotic cell cycle
microtubule-based process
cytoskeleton organization
ciliary basal body-plasma membrane docking
regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
microtubule cytoskeleton organization
GO:0007067 мітоз
GO:1904739 regulation of synapse organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7846
22142
Ensembl
ENSG00000167552
ENSMUSG00000072235
UniProt
Q71U36
P68369
RefSeq (мРНК)
NM_006009
NM_001270399
NM_001270400
NM_011653
RefSeq (білок)
NP_001257328
NP_001257329
NP_006000
NP_035783
Локус (UCSC) Хр. 12: 49.18 – 49.19 Mb Хр. 15: 98.85 – 98.85 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TUBA1A (англ. Tubulin alpha 1a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 50 136[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFN
TFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAA
NNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFT
SLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDC
AFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNV
DLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPAN
QMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTG
FKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYA
KRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEE
Y

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

  • Hall J.L., Cowan N.J. (1985). Structural features and restricted expression of a human alpha-tubulin gene. Nucleic Acids Res. 13: 207—223. PMID 3839072 DOI:10.1093/nar/13.1.207
  • Crabtree D.V., Ojima I., Geng X., Adler A.J. (2001). Tubulins in the primate retina: evidence that xanthophylls may be endogenous ligands for the paclitaxel-binding site. Bioorg. Med. Chem. 9: 1967—1976. PMID 11504633 DOI:10.1016/S0968-0896(01)00103-1
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cowan N.J., Dobner P., Fuchs E.V., Cleveland D.W. (1983). Expression of human alpha-tubulin genes: interspecies conservation of 3' untranslated regions. Mol. Cell. Biol. 3: 1738—1745. PMID 6646120 DOI:10.1128/MCB.3.10.1738
  • Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 DOI:10.1016/j.cell.2016.01.019
  • Nirschl J.J., Magiera M.M., Lazarus J.E., Janke C., Holzbaur E.L. (2016). Alpha-tubulin tyrosination and CLIP-170 phosphorylation regulate the initiation of dynein-driven transport in neurons. Cell Rep. 14: 2637—2652. PMID 26972003 DOI:10.1016/j.celrep.2016.02.046

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TUBA1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin alpha 1a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20766 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  6. UniProt, Q71U36 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські