HFM1

Ідентифікатори

Символи

HFM1, MER3, POF9, SEC63D1, Si-11, Si-11-6, helicase, ATP-dependent DNA helicase homolog, ATP dependent DNA helicase homolog, helicase for meiosis 1

Зовнішні ІД

OMIM: 615684 MGI: 3036246 HomoloGene: 87103 GeneCards: HFM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity
Клітинна компонента	• ядерце • цитоплазма
Біологічний процес	• resolution of meiotic recombination intermediates • GO:0007126 мейоз • RNA secondary structure unwinding
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


164045


330149

Ensembl


ENSG00000162669


ENSMUSG00000043410

UniProt


A2PYH4 C9JQ07


D3Z4R1

RefSeq (мРНК)


NM_001017975


NM_001252516 NM_177873

RefSeq (білок)


NP_001017975


NP_001239445 NP_808541

Локус (UCSC)

Хр. 1: 91.26 – 91.4 Mb

Хр. 5: 106.84 – 106.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HFM1 (англ. HFM1, ATP dependent DNA helicase homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 435 амінокислот, а молекулярна маса — 162 610^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLKSNDCLFS	LENLFFEKPD	EVENHPDNEK	SLDWFLPPAP	LISEIPDTQE
LEEELESHKL	LGQEKRPKML	TSNLKITNED	TNYISLTQKF	QFAFPSDKYE
QDDLNLEGVG	NNDLSHIAGK	LTYASQKYKN	HIGTEIAPEK	SVPDDTKLVN
FAEDKGESTS	VFRKRLFKIS	DNIHGSAYSN	DNELDSHIGS	VKIVQTEMNK
GKSRNYSNSK	QKFQYSANVF	TANNAFSASE	IGEGMFKAPS	FSVAFQPHDI
QEVTENGLGS	LKAVTEIPAK	FRSIFKEFPY	FNYIQSKAFD	DLLYTDRNFV
ICAPTGSGKT	VVFELAITRL	LMEVPLPWLN	IKIVYMAPIK	ALCSQRFDDW
KEKFGPIGLN	CKELTGDTVM	DDLFEIQHAH	IIMTTPEKWD	SMTRKWRDNS
LVQLVRLFLI	DEVHIVKDEN	RGPTLEVVVS	RMKTVQSVSQ	TLKNTSTAIP
MRFVAVSATI	PNAEDIAEWL	SDGERPAVCL	KMDESHRPVK	LQKVVLGFPC
SSNQTEFKFD	LTLNYKIASV	IQMYSDQKPT	LVFCATRKGV	QQAASVLVKD
AKFIMTVEQK	QRLQKYAYSV	RDSKLRDILK	DGAAYHHAGM	ELSDRKVVEG
AFTVGDLPVL	FTTSTLAMGV	NLPAHLVVIK	STMHYAGGLF	EEYSETDILQ
MIGRAGRPQF	DTTATAVIMT	RLSTRDKYIQ	MLACRDTVES	SLHRHLIEHL
NAEIVLHTIT	DVNIAVEWIR	STLLYIRALK	NPSHYGFASG	LNKDGIEAKL
QELCLKNLND	LSSLDLIKMD	EGVNFKPTEA	GRLMAWYYIT	FETVKKFYTI
SGKETLSDLV	TLIAGCKEFL	DIQLRINEKK	TLNTLNKDPN	RITIRFPMEG
RIKTREMKVN	CLIQAQLGCI	PIQDFALTQD	TAKIFRHGSR	ITRWLSDFVA
AQEKKFAVLL	NSLILAKCFR	CKLWENSLHV	SKQLEKIGIT	LSNAIVNAGL
TSFKKIEETD	ARELELILNR	HPPFGTQIKE	TVMYLPKYEL	KVEQITRYSD
TTAEILVTVI	LRNFEQLQTK	RTASDSHYVT	LIIGDADNQV	VYLHKITDSV
LLKAGSWAKK	IAVKRALKSE	DLSINLISSE	FVGLDIQQKL	TVFYLEPKRF
GNQITMQRKS	ETQISHSKHS	DISTIAGPNK	GTTASKKPGN	RECNHLCKSK
HTCGHDCCKI	GVAQKSEIKE	STISSYLSDL	RNRNAVSSVP	PVKRLKIQMN
KSQSVDLKEF	GFTPKPSLPS	ISRSEYLNIS	ELPIMEQWDQ	PEIYGKVRQE
PSEYQDKEVL	NVNFELGNEV	WDDFDDENLE	VTSFSTDTEK	TKISGFGNTL
SSSTRGSKLP	LQESKSKFQR	EMSNSFVSSH	EMSDISLSNS	AMPKFSASSM
TKLPQQAGNA	VIVHFQERKP	QNLSPEIEKQ	CFTFSEKNPN	SSNYKKVDFF
IRNSECKKEV	DFSMYHPDDE	ADEMKSLLGI	FDGIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Tanaka K., Miyamoto N., Shouguchi-Miyata J., Ikeda J.E. (2006). HFM1, the human homologue of yeast Mer3, encodes a putative DNA helicase expressed specifically in germ-line cells. DNA Seq. 17: 242—246. PMID 17286053 DOI:10.1080/10425170600805433

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20193 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, A2PYH4 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 28 серпня 2017.