ADAMTS5

ADAMTS5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2RJQ, 3B8Z, 3HY7, 3HY9, 3HYG, 3LJT

Ідентифікатори
Символи ADAMTS5, ADAM-TS 11, ADAM-TS 5, ADAM-TS5, ADAMTS-11, ADAMTS-5, ADAMTS11, ADMP-2, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5
Зовнішні ІД OMIM: 605007 MGI: 1346321 HomoloGene: 5109 GeneCards: ADAMTS5
Онтологія гена
Молекулярна функція

• heparin binding
• zinc ion binding
• extracellular matrix binding
• зв'язування з іоном металу
• integrin binding
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• metalloendopeptidase activity

Клітинна компонента

• endoplasmic reticulum lumen
• extracellular region
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• extracellular matrix disassembly
• протеоліз
• defense response to bacterium
• Прорізування зубів
• negative regulation of cold-induced thermogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
11096
23794
Ensembl
ENSG00000154736
ENSMUSG00000022894
UniProt
Q9UNA0
Q9R001
RefSeq (мРНК)
NM_007038
NM_011782
RefSeq (білок)
NP_008969
NP_035912
Локус (UCSC) Хр. 21: 26.92 – 26.97 Mb Хр. 16: 85.65 – 85.7 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ADAMTS5 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 101 718[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLLGWASLLLCAFRLPLAAVGPAATPAQDKAGQPPTAAAAAQPRRRQGEE
VQERAEPPGHPHPLAQRRRSKGLVQNIDQLYSGGGKVGYLVYAGGRRFLL
DLERDGSVGIAGFVPAGGGTSAPWRHRSHCFYRGTVDGSPRSLAVFDLCG
GLDGFFAVKHARYTLKPLLRGPWAEEEKGRVYGDGSARILHVYTREGFSF
EALPPRASCETPASTPEAHEHAPAHSNPSGRAALASQLLDQSALSPAGGS
GPQTWWRRRRRSISRARQVELLLVADASMARLYGRGLQHYLLTLASIANR
LYSHASIENHIRLAVVKVVVLGDKDKSLEVSKNAATTLKNFCKWQHQHNQ
LGDDHEEHYDAAILFTREDLCGHHSCDTLGMADVGTICSPERSCAVIEDD
GLHAAFTVAHEIGHLLGLSHDDSKFCEETFGSTEDKRLMSSILTSIDASK
PWSKCTSATITEFLDDGHGNCLLDLPRKQILGPEELPGQTYDATQQCNLT
FGPEYSVCPGMDVCARLWCAVVRQGQMVCLTKKLPAVEGTPCGKGRICLQ
GKCVDKTKKKYYSTSSHGNWGSWGSWGQCSRSCGGGVQFAYRHCNNPAPR
NNGRYCTGKRAIYRSCSLMPCPPNGKSFRHEQCEAKNGYQSDAKGVKTFV
EWVPKYAGVLPADVCKLTCRAKGTGYYVVFSPKVTDGTECRLYSNSVCVR
GKCVRTGCDGIIGSKLQYDKCGVCGGDNSSCTKIVGTFNKKSKGYTDVVR
IPEGATHIKVRQFKAKDQTRFTAYLALKKKNGEYLINGKYMISTSETIID
INGTVMNYSGWSHRDDFLHGMGYSATKEILIVQILATDPTKPLDVRYSFF
VPKKSTPKVNSVTSHGSNKVGSHTSQPQWVTGPWLACSRTCDTGWHTRTV
QCQDGNRKLAKGCPLSQRPSAFKQCLLKKC

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hurskainen T.L., Hirohata S., Seldin M.F., Apte S.S. (1999). ADAM-TS5, ADAM-TS6, and ADAM-TS7, novel members of a new family of zinc metalloproteases. J. Biol. Chem. 274: 25555—25563. PMID 10464288 DOI:10.1074/jbc.274.36.25555
  • Wang L.W., Leonhard-Melief C., Haltiwanger R.S., Apte S.S. (2009). Post-translational modification of thrombospondin type-1 repeats in ADAMTS-like 1/punctin-1 by C-mannosylation of tryptophan. J. Biol. Chem. 284: 30004—30015. PMID 19671700 DOI:10.1074/jbc.M109.038059

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:221 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9UNA0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.