Majör bazik protein

PRG2
Uygun yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi

1H8U, 2BRS, 4QXX

Tanımlayıcılar
Başka adlarPRG2, BMPG, proMBP, MBP, MBP1, proteoglikan 2 - kemik iliği (öldürücü hücre aktivatörü, eozinofil granülü majör bazik proteini), proteoglikan 2 - pro-eozinofil major bazik proteini
Dış kimliklerOMIM: 605601 MGI: 103294 HomoloGene: 2044 GeneCards: PRG2
Gen yerleşimi (İnsan)
11. Kromozom (insan)
Krom.11. Kromozom (insan)[1]
11. Kromozom (insan)
PRG2 için genom yerleşimi
PRG2 için genom yerleşimi
Bant11q12.1Başlangıç57,386,780 bç[1]
Bitiş57,390,650 bç[1]
RNA ekspresyonu deseni
Daha çok ekspresyon verisi başvurusu
Gen ontolojisi
Moleküler işlevi• heparin binding
• carbohydrate binding
• extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance
Hücresel bileşeni• extracellular region
• transport vesicle
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• extracellular exosome
• ficolin-1-rich granule lumen
• collagen-containing extracellular matrix
Biyolojik süreci• defense response to bacterium
• immune system process
• defense response to nematode
• negative regulation of interleukin-10 production
• positive regulation of interleukin-4 production
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Bağışıklık yanıtı
• neutrophil degranulation
Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez

5553

19074

Ensembl

ENSG00000186652

ENSMUSG00000027073

UniProt

P13727

Q61878

RefSeq (mRNA)

NM_002728
NM_001243245
NM_001302926
NM_001302927

NM_008920

RefSeq (protein)

NP_001230174
NP_001289855
NP_001289856
NP_002719

NP_032946

Yerleşim (UCSC)Krom. 11: 57.39 – 57.39 Mbn/a
PubMed araması[2][3]
Vikiveri
İnsan'ı Gör/DüzenleFare'yi Gör/Düzenle

Eozinofil majör bazik proteini veya genellikle kısaltılmış olarak majör bazik protein (MBP; ayrıca Proteoglikan 2 (PRG2) olarak da adlandırılmaktadır), insanlarda PRG2 geni tarafından kodlanmaktadır.[4]

İşlev

Bu gen tarafından kodlanan protein, eozinofil granülünün kristal çekirdeğinin baskın bir bileşenidir. Bu proteinin proformu, plasenta ve gebelik serumunda da yüksek düzeyde bulunur, burada gebelikle ilişkili plazma proteini A (PAPPA), anjiyotensinojen (AGT) ve C3dg de içinde olmak üzere diğer birçok proteinle kompleks halinde bulunur. Bu protein, sitotoksin ve helmint toksini olarak antiparazitik savunma mekanizmalarına ve immün aşırıduyarlılık tepkimelerine girebilir. Alerji hastalıklarında epitelyal hücre hasarı, eksfoliyasyon ve bronkospazm ile doğrudan ilişkilidir.[4]

PRG2, eozinofil granüllerinde baskın olan 117-kalıntı proteinidir. Helmintlere karşı etkili bir enzimdir ve in vitro bakteri ve memeli hücrelerine karşı toksiktir. Eozinofil majör bazik protein ayrıca mast hücrelerinden ve bazofillerden histamin salınmasını sağlar ve nötrofiller ile alveoler makrofajları etkinleştirir.

Yapı

Yapısal olarak majör bazik protein, lektinler (şeker bağlayıcı proteinler) ile benzerdir ve C tipi lektinlerde görülene benzer bir katlantıya sahiptir. Bununla birlikte diğer C tipi lektinlerden (bunlar, kalsiyum varlığında çeşitli karbonhidratları bağlayanlardır) farklı olarak MPB, kalsiyumu veya bu ailenin tanıdığı diğer karbonhidratların hiçbirini bağlamaz.

Bunun yerine MBP, heparan sülfat proteoglikanlarını tanır. MBP'nin iki kristalografik yapısı belirlenmiştir.[5][6]

Etkileşimler

Majör bazik proteinin gebelik ile ilişkili plazma proteini A ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.[7][8][9]

Ayrıca bakınız

  • Arilsülfataz

Kaynakça

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186652 - Ensembl, May 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Arşivlenmesi gereken bağlantıya sahip kaynak şablonu içeren maddeler (link)
  3. ^ "Fare PubMed Başvurusu:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Arşivlenmesi gereken bağlantıya sahip kaynak şablonu içeren maddeler (link)
  4. ^ a b "Entrez Gene: PRG2 proteoglycan 2, bone marrow (natural killer cell activator, eosinophil granule major basic protein)". 2 Kasım 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  5. ^ PDB: 1h8u​; "Crystal structure of the eosinophil major basic protein at 1.8 A. An atypical lectin with a paradigm shift in specificity". J. Biol. Chem. 276 (28). Temmuz 2001. ss. 26197-26203. 
  6. ^ PDB: 2brs​; "Eosinophil-granule major basic protein, a C-type lectin, binds heparin". Biochemistry. 44 (43). Kasım 2005. ss. 14152-14158. 
  7. ^ Overgaard (Ekim 2000). "Expression of recombinant human pregnancy-associated plasma protein-A and identification of the proform of eosinophil major basic protein as its physiological inhibitor". J. Biol. Chem. 275 (40). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 31128-31133. 
  8. ^ "Complex of pregnancy-associated plasma protein-A and the proform of eosinophil major basic protein. Disulfide structure and carbohydrate attachment". J. Biol. Chem. 278 (4). Amerika Birleşik Devletleri. Ocak 2003. ss. 2106-2117. 
  9. ^ Oxvig (Haziran 1993). "Circulating human pregnancy-associated plasma protein-A is disulfide-bridged to the proform of eosinophil major basic protein". J. Biol. Chem. 268 (17). Amerika Birleşik Devletleri. ss. 12243-6. 

Konuyla ilgili yayınlar

  • Vanhaesebroeck B, Alessi DR (2000). "The PI3K-PDK1 connection: more than just a road to PKB". Biochem. J. 346 (3). ss. 561-76. doi:10.1042/0264-6021.3460561. PMC 1220886 $2. PMID 10698680. 
  • Yoshimatsu K, Ohya Y, Shikata Y, Toshio S, Yoshikazu H, Isao T, Tamio K, Kyousuke K, Satoshi T (1992). "Purification and cDNA cloning of a novel factor produced by a human T-cell hybridoma: sequence homology with animal lectins". Mol. Immunol. 29 (4). ss. 537-546. doi:10.1016/0161-5890(92)90012-M. PMID 1565101. 
  • Barker RL, Loegering DA, Arakawa KC, Pease LR, Gleich GJ (1990). "Cloning and sequence analysis of the human gene encoding eosinophil major basic protein". Gene. 86 (2). ss. 285-289. doi:10.1016/0378-1119(90)90292-Y. PMID 2323577. 
  • Gabay JE, Scott RW, Campanelli D, Griffith J, Wilde C, Marra MN, Seeger M, Nathan CF (1989). "Antibiotic proteins of human polymorphonuclear leukocytes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86 (14). ss. 5610-5614. Bibcode:1989PNAS...86.5610G. doi:10.1073/pnas.86.14.5610. PMC 297672 $2. PMID 2501794. 
  • Wasmoen TL, McKean DJ, Benirschke K, Coulam CB, Gleich GJ (1990). "Evidence of eosinophil granule major basic protein in human placenta". J. Exp. Med. 170 (6). ss. 2051-2063. doi:10.1084/jem.170.6.2051. PMC 2189540 $2. PMID 2584934. 
  • Barker RL, Gleich GJ, Pease LR (1988). "Acidic precursor revealed in human eosinophil granule major basic protein cDNA". J. Exp. Med. 168 (4). ss. 1493-1498. doi:10.1084/jem.168.4.1493. PMC 2189086 $2. PMID 3171483. 
  • McGrogan M, Simonsen C, Scott R, Griffith J, Ellis N, Kennedy J, Campanelli D, Nathan C, Gabay J (1989). "Isolation of a complementary DNA clone encoding a precursor to human eosinophil major basic protein". J. Exp. Med. 168 (6). ss. 2295-2308. doi:10.1084/jem.168.6.2295. PMC 2189145 $2. PMID 3199069. 
  • Wasmoen TL, Bell MP, Loegering DA, Gleich GJ, Prendergast FG, McKean DJ (1988). "Biochemical and amino acid sequence analysis of human eosinophil granule major basic protein". J. Biol. Chem. 263 (25). ss. 12559-63. PMID 3410852. 
  • Weller PF, Ackerman SJ, Smith JA (1988). "Eosinophil granule cationic proteins: major basic protein is distinct from the smaller subunit of eosinophil peroxidase". J. Leukoc. Biol. 43 (1). ss. 1-4. doi:10.1002/jlb.43.1.1. PMID 3422083. 
  • Kristensen T, Oxvig C, Sand O, Hundahl Moeller NP, Sottrup-Jensen L (1994). "Amino acid sequence of human pregnancy-associated plasma protein-A derived from cloned cDNA". Biochemistry. 33 (6). ss. 1592-1598. doi:10.1021/bi00172a040. PMID 7508748. 
  • Oxvig C, Haaning J, Højrup P, Sottrup-Jensen L (1994). "Location and nature of carbohydrate groups in proform of human major basic protein isolated from pregnancy serum". Biochem. Mol. Biol. Int. 33 (2). ss. 329-36. PMID 7524900. 
  • Bonno M, Oxvig C, Kephart GM, Wagner JM, Kristensen T, Sottrup-Jensen L, Gleich GJ (1994). "Localization of pregnancy-associated plasma protein-A and colocalization of pregnancy-associated plasma protein-A messenger ribonucleic acid and eosinophil granule major basic protein messenger ribonucleic acid in placenta". Lab. Invest. 71 (4). ss. 560-6. PMID 7526035. 
  • Li MS, Sun L, Satoh T, Fisher LM, Spry CJ (1995). "Human eosinophil major basic protein, a mediator of allergic inflammation, is expressed by alternative splicing from two promoters". Biochem. J. 305 (3). ss. 921-7. doi:10.1042/bj3050921. PMC 1136346 $2. PMID 7531438. 
  • Oxvig C, Haaning J, Kristensen L, Wagner JM, Rubin I, Stigbrand T, Gleich GJ, Sottrup-Jensen L (1995). "Identification of angiotensinogen and complement C3dg as novel proteins binding the proform of eosinophil major basic protein in human pregnancy serum and plasma". J. Biol. Chem. 270 (23). ss. 13645-13651. doi:10.1074/jbc.270.23.13645 Özgürce erişilebilir. PMID 7539791. 
  • Oxvig C, Sand O, Kristensen T, Gleich GJ, Sottrup-Jensen L (1993). "Circulating human pregnancy-associated plasma protein-A is disulfide-bridged to the proform of eosinophil major basic protein". J. Biol. Chem. 268 (17). ss. 12243-6. PMID 7685339. 
  • Levi-Schaffer F, Lacy P, Severs NJ, Newman TM, North J, Gomperts B, Kay AB, Moqbel R (1995). "Association of granulocyte-macrophage colony-stimulating factor with the crystalloid granules of human eosinophils". Blood. 85 (9). ss. 2579-86. doi:10.1182/blood.V85.9.2579.bloodjournal8592579 Özgürce erişilebilir. PMID 7727786. 
  • Oxvig C, Gleich GJ, Sottrup-Jensen L (1994). "Localization of disulfide bridges and free sulfhydryl groups in human eosinophil granule major basic protein" (PDF). FEBS Lett. 341 (2-3). ss. 213-217. doi:10.1016/0014-5793(94)80459-1. PMID 8137941. 22 Eylül 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi (PDF). Erişim tarihi: 9 Mayıs 2020. 
  • Shikata Y, Hayashi Y, Yoshimatsu K, Ohya Y, Seto T, Fukushima K, Yoshida Y (1993). "Pro-major basic protein has three types of sugar chains at the pro-portion". Biochim. Biophys. Acta. 1163 (3). ss. 243-9. doi:10.1016/0167-4838(93)90158-N. PMID 8507662. 
  • Nittoh T, Watanabe M, Okayama H, Misawa S, Isobe Y, Hayashi H, Mue S, Ohuchi K (1996). "Cloning of cDNA for rat eosinophil major basic protein". Biochim. Biophys. Acta. 1264 (3). ss. 261-4. doi:10.1016/0167-4781(95)00183-2. PMID 8547309. 
  • Delcommenne M, Tan C, Gray V, Rue L, Woodgett J, Dedhar S (1998). "Phosphoinositide-3-OH kinase-dependent regulation of glycogen synthase kinase 3 and protein kinase B/AKT by the integrin-linked kinase". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (19). ss. 11211-11216. Bibcode:1998PNAS...9511211D. doi:10.1073/pnas.95.19.11211. PMC 21621 $2. PMID 9736715. 

Dış bağlantılar

  • Medical Subject Headings Eosinophil+Major+Basic+Protein
  • PDBe-KB üzerinde PDB'de UniProt: P13727 (kemik iliği proteoglikanı) için uygun bütün yapısal bilgilere bir bakış.